Karpaty są domem dla największych w Europie populacji niedźwiedzi brunatnych, wilków, kozic i rysi, z największą koncentracją w Rumunii, a także ponad jednej trzeciej wszystkich europejskich gatunków roślin. Rumunia jest krajem o największej liczbie niedźwiedzi brunatnych w Europie – według rumuńskiego Ministerstwa Środowiska w Rumunii żyje ich około 8000.
W górach i u ich podnóża znajduje się również wiele wód termalnych i mineralnych, a Rumunia posiada jedną trzecią całkowitej ich ilości w Europie. Rumunia jest również domem dla drugiego co do wielkości obszaru dziewiczych lasów w Europie po Rosji, o łącznej powierzchni 250 000 hektarów (65%), z których większość znajduje się w Karpatach. Karpaty Południowe stanowią największy niezagospodarowany obszar leśny w Europie.
